MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 34064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015975	TTGT	2	8	425	432	0 %	75 %	25 %	0 %	347524523
2	NC_015975	ACG	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524523
3	NC_015975	ATA	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524523
4	NC_015975	TGC	2	6	518	523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524523
5	NC_015975	ATT	2	6	551	556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524523
6	NC_015975	A	6	6	596	601	100 %	0 %	0 %	0 %	347524523
7	NC_015975	A	6	6	611	616	100 %	0 %	0 %	0 %	347524523
8	NC_015975	CTG	2	6	625	630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524523
9	NC_015975	GAA	2	6	640	645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524523
10	NC_015975	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524523
11	NC_015975	GAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524523
12	NC_015975	ATT	2	6	707	712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524523
13	NC_015975	TCA	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524523
14	NC_015975	GCA	2	6	832	837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524523
15	NC_015975	TCA	2	6	1004	1009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524523
16	NC_015975	A	6	6	1045	1050	100 %	0 %	0 %	0 %	347524523
17	NC_015975	TGA	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524523
18	NC_015975	AAG	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524523
19	NC_015975	ATG	2	6	1148	1153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524523
20	NC_015975	A	6	6	1156	1161	100 %	0 %	0 %	0 %	347524523
21	NC_015975	A	6	6	1211	1216	100 %	0 %	0 %	0 %	347524523
22	NC_015975	CGC	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524523
23	NC_015975	A	7	7	1296	1302	100 %	0 %	0 %	0 %	347524523
24	NC_015975	GAT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524523
25	NC_015975	ACG	2	6	1438	1443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524523
26	NC_015975	GCA	2	6	1450	1455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524523
27	NC_015975	CTT	2	6	1484	1489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524523
28	NC_015975	TAC	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524523
29	NC_015975	A	6	6	1567	1572	100 %	0 %	0 %	0 %	347524523
30	NC_015975	CTT	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524523
31	NC_015975	CGG	2	6	1665	1670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524523
32	NC_015975	ACG	2	6	1681	1686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524523
33	NC_015975	A	6	6	1723	1728	100 %	0 %	0 %	0 %	347524523
34	NC_015975	A	6	6	1741	1746	100 %	0 %	0 %	0 %	347524523
35	NC_015975	AAC	2	6	2029	2034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524524
36	NC_015975	GCA	2	6	2094	2099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524524
37	NC_015975	GAA	2	6	2162	2167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524524
38	NC_015975	GTT	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524524
39	NC_015975	T	6	6	2195	2200	0 %	100 %	0 %	0 %	347524524
40	NC_015975	AAC	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524524
41	NC_015975	CA	3	6	2496	2501	50 %	0 %	0 %	50 %	347524524
42	NC_015975	CAACG	2	10	2533	2542	40 %	0 %	20 %	40 %	347524524
43	NC_015975	AAGC	2	8	2578	2585	50 %	0 %	25 %	25 %	347524524
44	NC_015975	CGT	2	6	2667	2672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524524
45	NC_015975	ACG	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524524
46	NC_015975	ACG	2	6	2738	2743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524524
47	NC_015975	GCT	2	6	2764	2769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524524
48	NC_015975	GCTTC	2	10	2786	2795	0 %	40 %	20 %	40 %	347524524
49	NC_015975	CAA	2	6	2812	2817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524524
50	NC_015975	GTT	2	6	2819	2824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524524
51	NC_015975	GAA	2	6	2894	2899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524524
52	NC_015975	CGA	2	6	2926	2931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524524
53	NC_015975	AGA	2	6	3046	3051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524524
54	NC_015975	GTTC	2	8	3057	3064	0 %	50 %	25 %	25 %	347524524
55	NC_015975	T	6	6	3098	3103	0 %	100 %	0 %	0 %	347524525
56	NC_015975	CTTTT	2	10	3136	3145	0 %	80 %	0 %	20 %	347524525
57	NC_015975	T	6	6	3142	3147	0 %	100 %	0 %	0 %	347524525
58	NC_015975	AAAG	2	8	3174	3181	75 %	0 %	25 %	0 %	347524525
59	NC_015975	T	6	6	3187	3192	0 %	100 %	0 %	0 %	347524525
60	NC_015975	A	6	6	3355	3360	100 %	0 %	0 %	0 %	347524526
61	NC_015975	GTT	2	6	3399	3404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524526
62	NC_015975	AAG	2	6	3508	3513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524526
63	NC_015975	GTT	2	6	3532	3537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524526
64	NC_015975	GAA	2	6	3604	3609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524527
65	NC_015975	AATC	2	8	3702	3709	50 %	25 %	0 %	25 %	347524527
66	NC_015975	ACG	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
67	NC_015975	A	6	6	3774	3779	100 %	0 %	0 %	0 %	347524527
68	NC_015975	A	7	7	3804	3810	100 %	0 %	0 %	0 %	347524527
69	NC_015975	A	6	6	3845	3850	100 %	0 %	0 %	0 %	347524527
70	NC_015975	CGC	2	6	3882	3887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524527
71	NC_015975	AT	3	6	3898	3903	50 %	50 %	0 %	0 %	347524527
72	NC_015975	GGA	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347524527
73	NC_015975	AGA	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524527
74	NC_015975	AGC	2	6	4074	4079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
75	NC_015975	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
76	NC_015975	TGCA	2	8	4209	4216	25 %	25 %	25 %	25 %	347524527
77	NC_015975	GCA	2	6	4225	4230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
78	NC_015975	GAT	2	6	4274	4279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524527
79	NC_015975	TCG	2	6	4335	4340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524527
80	NC_015975	ACG	2	6	4361	4366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
81	NC_015975	AACG	2	8	4446	4453	50 %	0 %	25 %	25 %	347524527
82	NC_015975	T	6	6	4603	4608	0 %	100 %	0 %	0 %	347524527
83	NC_015975	GAC	2	6	4609	4614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
84	NC_015975	AGC	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
85	NC_015975	ATC	2	6	4706	4711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524527
86	NC_015975	A	6	6	4721	4726	100 %	0 %	0 %	0 %	347524527
87	NC_015975	A	6	6	4802	4807	100 %	0 %	0 %	0 %	347524528
88	NC_015975	AGA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524528
89	NC_015975	ATG	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524528
90	NC_015975	CCAG	2	8	4838	4845	25 %	0 %	25 %	50 %	347524528
91	NC_015975	CGA	2	6	4983	4988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524528
92	NC_015975	ACA	2	6	5012	5017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524528
93	NC_015975	CGG	2	6	5127	5132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524528
94	NC_015975	ACG	2	6	5362	5367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524528
95	NC_015975	GAC	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524528
96	NC_015975	AGA	2	6	5472	5477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524528
97	NC_015975	GCGG	2	8	5488	5495	0 %	0 %	75 %	25 %	347524528
98	NC_015975	CAA	2	6	5520	5525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524528
99	NC_015975	AAG	2	6	5530	5535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524528
100	NC_015975	CGA	2	6	5544	5549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524528
101	NC_015975	CTG	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524528
102	NC_015975	AAC	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524528
103	NC_015975	CG	3	6	5702	5707	0 %	0 %	50 %	50 %	347524528
104	NC_015975	GC	3	6	5722	5727	0 %	0 %	50 %	50 %	347524528
105	NC_015975	GAAA	2	8	5742	5749	75 %	0 %	25 %	0 %	347524528
106	NC_015975	ACG	2	6	5750	5755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524528
107	NC_015975	GTT	2	6	5797	5802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524528
108	NC_015975	AAACCA	2	12	5837	5848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524528
109	NC_015975	CG	3	6	5865	5870	0 %	0 %	50 %	50 %	347524528
110	NC_015975	TGCT	2	8	5960	5967	0 %	50 %	25 %	25 %	347524528
111	NC_015975	GC	3	6	5995	6000	0 %	0 %	50 %	50 %	347524528
112	NC_015975	ACA	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524528
113	NC_015975	TCG	2	6	6098	6103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524528
114	NC_015975	GAA	2	6	6226	6231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524528
115	NC_015975	ATC	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524528
116	NC_015975	CCGATG	2	12	6320	6331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347524528
117	NC_015975	GCT	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524528
118	NC_015975	GAT	2	6	6390	6395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524528
119	NC_015975	GCC	2	6	6423	6428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524528
120	NC_015975	GAT	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524528
121	NC_015975	GAA	2	6	6478	6483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524528
122	NC_015975	ACG	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524528
123	NC_015975	CGT	2	6	6601	6606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524528
124	NC_015975	TGC	2	6	6608	6613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524528
125	NC_015975	TCTG	2	8	6621	6628	0 %	50 %	25 %	25 %	347524528
126	NC_015975	GAA	2	6	6634	6639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524528
127	NC_015975	AAT	2	6	6721	6726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524528
128	NC_015975	TCG	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524529
129	NC_015975	TGCCT	2	10	6879	6888	0 %	40 %	20 %	40 %	347524529
130	NC_015975	GAAC	2	8	6939	6946	50 %	0 %	25 %	25 %	347524529
131	NC_015975	TCG	2	6	6989	6994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524529
132	NC_015975	TTG	2	6	7084	7089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524529
133	NC_015975	CAA	2	6	7197	7202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524529
134	NC_015975	ATG	2	6	7229	7234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524529
135	NC_015975	GTT	2	6	7252	7257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524529
136	NC_015975	GAC	2	6	7317	7322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524529
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138	NC_015975	CGA	2	6	7391	7396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524529
139	NC_015975	AGCTG	2	10	7398	7407	20 %	20 %	40 %	20 %	347524529
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142	NC_015975	GAAAA	2	10	7627	7636	80 %	0 %	20 %	0 %	347524529
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149	NC_015975	GCAA	2	8	7899	7906	50 %	0 %	25 %	25 %	347524529
150	NC_015975	ATC	2	6	7957	7962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524529
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155	NC_015975	ATT	2	6	8179	8184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524529
156	NC_015975	TGA	2	6	8220	8225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524529
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164	NC_015975	TCA	2	6	8537	8542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524529
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166	NC_015975	CAT	2	6	8766	8771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524529
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174	NC_015975	TGA	3	9	9168	9176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524529
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245	NC_015975	GTT	2	6	14105	14110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524535
246	NC_015975	TGCAT	2	10	14114	14123	20 %	40 %	20 %	20 %	347524535
247	NC_015975	GATT	2	8	14151	14158	25 %	50 %	25 %	0 %	347524535
248	NC_015975	CAT	2	6	14173	14178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524535
249	NC_015975	TTG	3	9	14184	14192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524535
250	NC_015975	AT	3	6	14233	14238	50 %	50 %	0 %	0 %	347524535
251	NC_015975	AGG	2	6	14274	14279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347524535
252	NC_015975	ATG	2	6	14313	14318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524535
253	NC_015975	TGA	2	6	14404	14409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524535
254	NC_015975	CGA	2	6	14440	14445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524535
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256	NC_015975	T	7	7	14517	14523	0 %	100 %	0 %	0 %	347524535
257	NC_015975	ATGA	2	8	14627	14634	50 %	25 %	25 %	0 %	347524535
258	NC_015975	AAG	2	6	14762	14767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524535
259	NC_015975	GAA	3	9	14771	14779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524535
260	NC_015975	CGG	2	6	14860	14865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524535
261	NC_015975	GAT	2	6	14867	14872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524535
262	NC_015975	CGG	2	6	14926	14931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524535
263	NC_015975	CGG	2	6	14977	14982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524535
264	NC_015975	GAT	2	6	15025	15030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524535
265	NC_015975	TGA	2	6	15051	15056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524535
266	NC_015975	TGA	2	6	15064	15069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524535
267	NC_015975	A	6	6	15155	15160	100 %	0 %	0 %	0 %	347524535
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270	NC_015975	GCT	2	6	15208	15213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524535
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275	NC_015975	CAA	2	6	15511	15516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524535
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278	NC_015975	TCGG	2	8	15617	15624	0 %	25 %	50 %	25 %	347524535
279	NC_015975	GAAA	2	8	15655	15662	75 %	0 %	25 %	0 %	347524535
280	NC_015975	TTGA	2	8	15692	15699	25 %	50 %	25 %	0 %	347524535
281	NC_015975	TGC	2	6	15734	15739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524535
282	NC_015975	GTC	2	6	15896	15901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524535
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284	NC_015975	GAA	2	6	15980	15985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524535
285	NC_015975	CTG	2	6	15986	15991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524535
286	NC_015975	ATT	2	6	15995	16000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524535
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372	NC_015975	A	7	7	20544	20550	100 %	0 %	0 %	0 %	347524540
373	NC_015975	A	6	6	20813	20818	100 %	0 %	0 %	0 %	347524541
374	NC_015975	AACGA	2	10	20914	20923	60 %	0 %	20 %	20 %	347524541
375	NC_015975	GCA	2	6	20963	20968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524541
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380	NC_015975	GCAG	2	8	21223	21230	25 %	0 %	50 %	25 %	347524541
381	NC_015975	AAG	2	6	21243	21248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524541
382	NC_015975	A	6	6	21344	21349	100 %	0 %	0 %	0 %	347524542
383	NC_015975	GAA	2	6	21371	21376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524542
384	NC_015975	TTC	2	6	21422	21427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524542
385	NC_015975	GC	3	6	21451	21456	0 %	0 %	50 %	50 %	347524542
386	NC_015975	ATAA	2	8	21457	21464	75 %	25 %	0 %	0 %	347524542
387	NC_015975	TGA	2	6	21567	21572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524543
388	NC_015975	GC	3	6	21592	21597	0 %	0 %	50 %	50 %	347524543
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